A Gólyafészek néven elhíresült ügy több mint egy éve okoz fejtörést Andrej Babiš cseh miniszterelnöknek. A rendőrség azzal gyanúsítja őt, hogy kormányfőként befolyásolta az uniós támogatások szétosztását olyan módon, hogy saját cégei, az Agrofert holding alá tartozó vállalatok jelentős támogatást kaptak. Az Európai Bizottság már júniusban azt mondta, amennyiben bebizonyosodnának a könyvvizsgálói jelentésben foglaltak, Csehországnak több száz millió koronát kellene visszafizetnie az Európai Uniónak. Azt a pénzt, amelyet korábban a kormányfő tulajdonában lévő vállalatok kaptak. Az uniós ellenőrök mintegy 250 oldalas jelentése szerint ez az összeg eléri a 451 millió koronát (5,9 milliárd forint).
Az uniós könyvvizsgálói jelentés végső változatát pénteken küldték el Csehországnak, ezt prágai kormányzati körök is megerősítették, de
a dokumentumot nem hozták nyilvánosságra,
és hivatalosan sem a tartalma, sem a vizsgálat eredménye nem ismeretes. Hogy a számadatok mégis napvilágot láttak, az a Deník N jobboldali cseh hírportálnak köszönhető.
Babiš szerdán, a jövő évi költségvetési vita megkezdése előtt, a képviselőházban elmondta, semmit nem fizet be a brüsszeli kasszába, mert nincs erre oka. „Abszurdnak tartom, ahogy az európai könyvvizsgálók értelmezik a cseh jogrendszert, és
kioktatnak minket
arról, hogyan értelmezzük azt” – hangoztatta a cseh miniszterelnök. Ismét leszögezte, hogy ő a törvény szerint járt el, amikor 2017 februárjában, a cseh összeférhetetlenségi törvény módosítása után speciális vagyonkezelő alapokba helyezte az Agrofert holdinghoz tartozó, több tízmilliárd koronás cégeit.
Andrej Babiš szerint a könnyvizsgálói jelentés végleges ugyan, de számára nem tűnik véglegesnek a döntés, mert csupán arra szólítja fel Csehországot, nyilatkozzon arról, hogy elfogadja-e a benne foglaltakat. A cseh miniszterelnök a kezdetektől fogva tagadja, hogy visszaélés történt volna az európai uniós pénzekkel. Babiš úgy véli, politikai kampányról van szó, amelynek célja eltávolítani őt a politikai életből. A brüsszeli vizsgálódásokat Csehország elleni politikai támadásnak tartja. Többször is úgy nyilatkozott, hogy a kormány megbuktatása megbénítaná Csehországot, amely soha nem volt olyan jó állapotban, mint most.