Ebben a szakaszban 16 csapat küzd egymással négy csoportban, amelyekből az első két-két helyezett jut a negyeddöntőbe. A magyar csapatot a második kalapból húzták a dán együttes mellé, majd a négy német közül az egyik, továbbá a 16-os csoportkör első izraeli résztvevője került még ide, a C jelű kvartettbe.
A mérkőzéseket február 11. és április 2. között rendezik.
A csoportok:
A csoport: Saint-Raphae:l (francia), Riko Ribnica (szlovén), GOG (dán), Füchse Berlin (német)
B csoport: Göppingen (német), Midtjylland (dán), BM Granollers (spanyol), Porto (portugál)
C csoport: Kolding (dán), Grundfos Tatabánya, Magdeburg (német), Makkabi Tel-Avív (izraeli)
D csoport: MT Melsungen (német), Helvetia Anaitasuna (spanyol), Benfica (portugál), Cocks (finn)
A csoportkör bevezetése óta csak német és magyar siker született a férfi kézilabda EHF Kupában: 2013-ban a Rhein-Neckar Löwen, 2014-ben a MOL-Pick Szeged, 2015-ben a Füchse Berlin, idén pedig a Göppingen diadalmaskodott.