Sándor Istvánt 1989. október 31-én választotta meg az Országgyűlés az 1990. január 1-jei hatállyal újjáalakult Állami Számvevőszék alelnökének. Megbízatását 2001. augusztus 17-ig - a 70. életéve betöltéséig - látta el.
Sándor István alelnökként meghatározó szerepet töltött be az 1989-es rendszerváltás után újjáalakult Állami Számvevőszék szervezeti kialakításában, valamint szakmai tevékenységének megszilárdításában.